Un informe presentado por la Contraloría General de la República (CGR) a la Comision de Investigación de hechos de corrupoción en el IPS y Salud Pública que preside el senador Dionisio Amarilla, expone una serie de observaciones sobre la gestión financiera y administrativa del IPS y el Ministerio de Salud Pública. Entre 2021 y 2026 se realizaron 48 actividades de control, 21 sobre el IPS y 27 sobre el MSPBS. En el caso del IPS, la auditoría financiera de 2025 detectó 20 hallazgos de incorrección material y un ajuste de G. 624.492 millones en existencias médicas, debido a que no se contaba con documentación suficiente para acreditar el destino de esos medicamentos. A esto se suma un déficit acumulado de G. 1,686 billones en el fondo previsional y una diferencia de G. 527.534 millones entre el activo y el pasivo corriente.
Uno de los puntos más delicados del informe corresponde a los pagos realizados después del fallecimiento de beneficiarios. La CGR identificó 11.562 registros de personas fallecidas y 24.790 pagos posteriores a sus defunciones, por un total de G. 58.046 millones. De ese monto, G. 28.028 millones todavía están pendientes de recuperación. El escenario financiero se agrava con una deuda histórica del Estado con el IPS de G. 5,044 billones y una morosidad de los aportes obrero-patronales de G. 5,426 billones. La Contraloría también informó que varios antecedentes fueron remitidos al Ministerio Público.
En el Ministerio de Salud, las auditorías también expusieron importantes deficiencias. La auditoría financiera de 2023 tuvo una opinión adversa basada en 22 fundamentos de incorrección material generalizada, mientras que la correspondiente a 2025 presentó salvedades. Entre 2021 y 2025, el MSPBS acumuló G. 25,393 billones en contratos, mientras que se detectaron observaciones relacionadas con medicamentos, inventarios, obras y controles hospitalarios. En el Hospital de Trauma fueron identificadas 9.319 unidades de medicamentos críticos, valuadas en G. 199 millones, cuyas salidas fueron justificadas con referencias como “Paciente NN” o “por consolidado”. Además, se observaron G. 37.538 millones en pagos de servicios personales sin suficiente documentación de respaldo.
El nivel de cumplimiento de las recomendaciones también preocupa: solo 20,5% de las acciones de mejora del IPS y 11,2% del MSPBS fueron cumplidas totalmente, según el reporte presentado al Senado.
